Родился в городке Халтерн германской провинции Северный Рейн-Вестфалия. Футбольная карьера защитника началась в 1999-м году в одном из клубов региональной немецкой лиги. Однако летом 2000 года Метцельдер подписал контракт с дортмундской «Боруссией», в составе которой и отыграл последующие семь лет.

Самым успешным для футболиста сезоном за все время, проведенное в составе «Боруссии», можно считать сезон-2001/02. Метцельдер закрепил за собой место в основном составе и выиграл золотые медали чемпионата Германии. Помимо этого защитник вместе с «Боруссией» дошел до финала Кубка УЕФА, а в составе национальной сборной Германии вышел в финал чемпионата мира 2002. В результате, Метцельдер был признан лучшим молодым игроком Европы 2002 года.

После этого успехи Метцельдера в Германии пошли по нисходящей. «Боруссия» потеряла прежние позиции, а футболисту, который начал регулярно привлекаться в состав национальной сборной, захотелось выиграть какой-нибудь международный трофей. В результате, сезон-2006/07 стал для него последним в составе «Боруссии». Всего в составе дортмундского клуба Метцельдер провел 126 матчей и забил два гола. Летом 2007 года защитник подписал контракт с мадридским «Реалом», который возглавил его соотечественник Бернд Шустер.

В составе национальной сборной Германии, помимо «серебра» чемпионата мира 2002 года, Метцельдер выиграл бронзовые медали мирового первенства 2006, которое проходило на его родине. Тогда защитник без замен отыграл в шести матчах, получив при этом две желтые карточки. Выиграл Кристоф медали (на этот раз – серебряные) и на чемпионате Европы – Метцельдер на Евро-2008 сыграл без замен все шесть матчей, и во многом именно его надежная игра помогла сборной добраться до финала турнира.

Серебряный призёр ЧМ-2002

Бронзовый призёр ЧМ-2006

Бронзовый призёр Кубка конфедераций 2005

Чемпион Германии: 2002

Финалист Кубка УЕФА: 2002

Лучший футболист Европы до 23 лет: 2002

Чемпион Испании сезона 2007/2008